andrew.wader
06.04.12, 16:51
Poszukując danych o możliwych biomarkerach ciężkiej depresji i innych zespołów psychiatrycznych natknąłem się na liczne prace dotyczące tzw. "functional connectivy".
Osoby cierpiące na schizofrenię mają upośledzenie owej "functional connectivity", co oznacza, że różne ośrodki mózgu wykazują upośledzone współdziałanie w domenie czasu ..
Wyróżnia się badania różnych form połączeń. Na wstępie strony www.scholarpedia.org/article/Brain_connectivity czytamy.:
["… Brain connectivity refers to a pattern of anatomical links ("anatomical connectivity"), of statistical dependencies ("functional connectivity") or of causal interactions ("effective connectivity") between distinct units within a nervous system. The units correspond to individual neurons, neuronal populations, or anatomically segregated brain regions. The connectivity pattern is formed by structural links such as synapses or fiber pathways, or it represents statistical or causal relationships measured as cross-correlations, coherence, or information flow. Neural activity, and by extension neural codes, are constrained by connectivity. Brain connectivity is thus crucial to elucidating how neurons and neural networks process information. .."]
Głównym narzędziem badań "functional connectivity są wysublimowane techniki funkcjonalnej tomografii magnetyczno – rezonansowej (fMRI)
Co więcej badania nad owy "połączeniami funkcjonalnymi w mózgu" doprowadziły do uruchomienie niebywałego, imponującego, ambitnego projektu zbadania wszystkich połączeń istniejących w mózgu człowieka. Ten niezwykły plan badań jest już w trakcie realizacji – vide .: www.humanconnectomeproject.org/
W największym uproszczeniu, wg. nawet skromnego "entry" w polskiej Wikipedii
pl.wikipedia.org/wiki/Konektom czytamy.:
[".. Konektom - kompletna mapa sieci połączeń neuronalnych. Termin odnosi się do sieci połączeń w mózgu, używany jest także do określenia kompletnej mapy połączeń nerwowych u gatunków nie posiadających ośrodkowego układu nerwowego (np.C. elegans). Nauka zajmująca się badaniem i mapowaniem konektomu nosi nazwę konektomiki.
Pojęcie konektom zostało po raz pierwszy użyte w pracach naukowych w 2005 roku niezależnie od siebie przez dwóch autorów: Olafa Spornsa z Indiana University oraz Patricka Hagmanna ze Szpitala Uniwersyteckiego w Lozannie.
Pierwszym i dotychczas jedynym w pełni poznanym konektomem jest sieć połączeń neuronów w układzie nerwowym nicienia Caenorhabditis elegans. Została ona opracowana poprzez trójwymiarową rekonstrukcję struktury nerwów przy użyciu mikroskopii elektronowej. Wynik prac opublikowany został w 1986 roku.
Największym obecnie przedsięwzięciem badawczym w ramach konektomiki jest fundowany przez amerykański Narodowy Instytut Zdrowia projekt poznania ludzkiego konektomu: "The Human Connectome Project". Uczestniczą w nim w ramach dwóch konsorcjów: Uniwersytet Waszyngtoński w Seattle wraz z Uniwersytetem Stanu Minnesota oraz Uniwersytet Kalifornijski wraz z Massachusetts General Hospital…"]
Pod en.wikipedia.org/wiki/Connectome jest oczywiście więcej.
Dlaczego jednak o tym.. tu … teraz … piszę ? Otóż konia z rzędem jeśli ktoś potrafiłby w sposób jasny i zrozumiały wyjaśnić osobom zainteresowanym istotę stosowanych technik z
Owszem proszę bardzo na początek przeczytać to co napisano pod
www.ncrrn.org/papers/methodology_papers/connectivityprimer.pdf
Wyzwaniem jest np. jasne, intuicyjnie zrozumiałe wyjaśnienie podstawowej techniki jaką jest Diffusion Tensor Imaging. (.. hi .. proszę popatrzeć np. na stronę en.wikipedia.org/wiki/Diffusion_MRI )
Czytając wspomniany "Functional connectivity primer " .. już w pierwszych linijkach trzeba rozszyfrować skrót BOLD [ pomagając.. jest to od .. Blood Oxyenation Level Dependent Contrast ( fMRI measurements are of amount of deoxyhemoglobin per voxel,
we assume that amount of deoxygenated hemoglobin is predictive of neuronal activity..) ]
Więcej na ten temat można przeczytac pod www.kyb.mpg.de/fileadmin/user_upload/files/publications/pdfs/pdf2893.pdf
Reasumując .. Ponieważ po.. Human Genome Project .. mamy.. teraz na tapacie Human Connectome Project .. nie ma innej radzy jak spróbowąć zrozumieć jak się to robi.
Jeśli ktoś z Państwa, ma osobiste doświadczenie w przybliżaniu podstaw tych badań w sposób prosty, zrozumiały intuicyjnie to zapraszam do współpracy ~ Andrew Wader