asteroida2
28.10.08, 17:10
Zacznę od tego linka:
en.wikipedia.org/wiki/Archon_X_Prize
W skrócie, wyścig o szybkie i tanie odczytywanie ludzkiego DNA trwa w
najlepsze i gra toczy się o duże pieniądze (raczej znacznie większe niż
wartość tej nagrody).
Oczywiście inżynierowie i chemicy zastanawiają się jak robić lepsze sekwencery
DNA i postęp tutaj jest całkiem szybki. Jednocześnie projekt ludzkiego genomu
pokazał, że problem jest też w dużej mierze informatyczny i zastosowanie
odpowiednich algorytmów może tutaj znacząco zmienić poziom trudności zadania.
Jeśli jest tutaj ktoś zorientowany w temacie, to być może będzie potrafił
odpowiedzieć na kilka pytań (które zresztą zdradzą pomysł jaki być może można
tu wykorzystać):
1. Jak duże są różnice pomiędzy genomami ludzi (w ilości par zasad)?
2. Jak te różnice są grupowane, tzn:
- jaka część różnic dotyczy pojedynczych par zasad, a jaka większych fragmentów?
- jeśli genomy dwóch ludzi różnią się na jakimś fragmencie, to w ilu wersjach
taki fragment może występować (modulo zmiany pojedynczych par zasad)?
- jak często w genomie występują długie fragmenty o identycznej sekwencji
zasad (znów modulo zmiany pojedynczych par)?
